Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN5

FOXI2, Forkhead box protein I2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI2Q6ZQN5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXI2Q6ZQN5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXI2Q6ZQN5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXI2Q6ZQN5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXI2Q6ZQN5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXI2Q6ZQN5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI2Q6ZQN5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI2Q6ZQN5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXI2Q6ZQN5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXI2Q6ZQN5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXI2Q6ZQN5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXI2Q6ZQN5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXI2Q6ZQN5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXI2Q6ZQN5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXI2Q6ZQN5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXI2Q6ZQN5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXI2Q6ZQN5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXI2Q6ZQN5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXI2Q6ZQN5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXI2Q6ZQN5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXI2Q6ZQN5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXI2Q6ZQN5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXI2Q6ZQN5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXI2Q6ZQN5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXI2Q6ZQN5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXI2Q6ZQN5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXI2Q6ZQN5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXI2Q6ZQN5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXI2Q6ZQN5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXI2Q6ZQN5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms