Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN04

MEX3B, RNA-binding protein MEX3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3BQ6ZN04 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEX3BQ6ZN04 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEX3BQ6ZN04 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEX3BQ6ZN04 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MEX3BQ6ZN04 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEX3BQ6ZN04 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MEX3BQ6ZN04 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEX3BQ6ZN04 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEX3BQ6ZN04 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEX3BQ6ZN04 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEX3BQ6ZN04 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEX3BQ6ZN04 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEX3BQ6ZN04 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEX3BQ6ZN04 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEX3BQ6ZN04 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEX3BQ6ZN04 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEX3BQ6ZN04 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEX3BQ6ZN04 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEX3BQ6ZN04 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEX3BQ6ZN04 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEX3BQ6ZN04 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEX3BQ6ZN04 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEX3BQ6ZN04 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms