Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMR5

TMPRSS11A, Transmembrane protease serine 11A, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11AQ6ZMR5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS11AQ6ZMR5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS11AQ6ZMR5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMPRSS11AQ6ZMR5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS11AQ6ZMR5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS11AQ6ZMR5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS11AQ6ZMR5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS11AQ6ZMR5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMPRSS11AQ6ZMR5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS11AQ6ZMR5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS11AQ6ZMR5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS11AQ6ZMR5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS11AQ6ZMR5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS11AQ6ZMR5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS11AQ6ZMR5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMPRSS11AQ6ZMR5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS11AQ6ZMR5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS11AQ6ZMR5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS11AQ6ZMR5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS11AQ6ZMR5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS11AQ6ZMR5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS11AQ6ZMR5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS11AQ6ZMR5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS11AQ6ZMR5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS11AQ6ZMR5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS11AQ6ZMR5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS11AQ6ZMR5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11AQ6ZMR5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPRSS11AQ6ZMR5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms