Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATF7IPQ6VMQ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATF7IPQ6VMQ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATF7IPQ6VMQ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATF7IPQ6VMQ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATF7IPQ6VMQ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATF7IPQ6VMQ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATF7IPQ6VMQ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATF7IPQ6VMQ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATF7IPQ6VMQ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATF7IPQ6VMQ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ATF7IPQ6VMQ6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATF7IPQ6VMQ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ATF7IPQ6VMQ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ATF7IPQ6VMQ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ATF7IPQ6VMQ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATF7IPQ6VMQ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATF7IPQ6VMQ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATF7IPQ6VMQ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATF7IPQ6VMQ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATF7IPQ6VMQ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATF7IPQ6VMQ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATF7IPQ6VMQ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ATF7IPQ6VMQ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATF7IPQ6VMQ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATF7IPQ6VMQ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ATF7IPQ6VMQ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATF7IPQ6VMQ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATF7IPQ6VMQ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATF7IPQ6VMQ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATF7IPQ6VMQ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATF7IPQ6VMQ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATF7IPQ6VMQ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATF7IPQ6VMQ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATF7IPQ6VMQ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATF7IPQ6VMQ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATF7IPQ6VMQ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATF7IPQ6VMQ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ATF7IPQ6VMQ6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATF7IPQ6VMQ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATF7IPQ6VMQ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATF7IPQ6VMQ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATF7IPQ6VMQ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATF7IPQ6VMQ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATF7IPQ6VMQ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATF7IPQ6VMQ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATF7IPQ6VMQ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATF7IPQ6VMQ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATF7IPQ6VMQ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATF7IPQ6VMQ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms