Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
FOXD4L3Q6VB84 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD4L3Q6VB84 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD4L3Q6VB84 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD4L3Q6VB84 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD4L3Q6VB84 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD4L3Q6VB84 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD4L3Q6VB84 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD4L3Q6VB84 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD4L3Q6VB84 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD4L3Q6VB84 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD4L3Q6VB84 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD4L3Q6VB84 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD4L3Q6VB84 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD4L3Q6VB84 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD4L3Q6VB84 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD4L3Q6VB84 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD4L3Q6VB84 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD4L3Q6VB84 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD4L3Q6VB84 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD4L3Q6VB84 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD4L3Q6VB84 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD4L3Q6VB84 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD4L3Q6VB84 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FOXD4L3Q6VB84 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD4L3Q6VB84 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD4L3Q6VB84 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD4L3Q6VB84 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD4L3Q6VB84 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD4L3Q6VB84 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD4L3Q6VB84 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD4L3Q6VB84 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD4L3Q6VB84 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD4L3Q6VB84 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD4L3Q6VB84 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD4L3Q6VB84 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FOXD4L3Q6VB84 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FOXD4L3Q6VB84 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FOXD4L3Q6VB84 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FOXD4L3Q6VB84 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FOXD4L3Q6VB84 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FOXD4L3Q6VB84 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FOXD4L3Q6VB84 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FOXD4L3Q6VB84 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FOXD4L3Q6VB84 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FOXD4L3Q6VB84 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD4L3Q6VB84 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD4L3Q6VB84 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD4L3Q6VB84 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
FOXD4L3Q6VB84 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms