Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNT2Q6UVM3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNT2Q6UVM3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNT2Q6UVM3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNT2Q6UVM3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNT2Q6UVM3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNT2Q6UVM3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNT2Q6UVM3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNT2Q6UVM3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNT2Q6UVM3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNT2Q6UVM3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNT2Q6UVM3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNT2Q6UVM3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNT2Q6UVM3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNT2Q6UVM3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNT2Q6UVM3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNT2Q6UVM3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNT2Q6UVM3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNT2Q6UVM3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNT2Q6UVM3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNT2Q6UVM3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNT2Q6UVM3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNT2Q6UVM3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNT2Q6UVM3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNT2Q6UVM3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNT2Q6UVM3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNT2Q6UVM3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNT2Q6UVM3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNT2Q6UVM3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNT2Q6UVM3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNT2Q6UVM3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNT2Q6UVM3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNT2Q6UVM3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNT2Q6UVM3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNT2Q6UVM3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNT2Q6UVM3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNT2Q6UVM3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNT2Q6UVM3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms