Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPN5Q6U736 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPN5Q6U736 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPN5Q6U736 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPN5Q6U736 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPN5Q6U736 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPN5Q6U736 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPN5Q6U736 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OPN5Q6U736 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPN5Q6U736 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
OPN5Q6U736 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPN5Q6U736 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPN5Q6U736 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
OPN5Q6U736 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPN5Q6U736 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPN5Q6U736 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OPN5Q6U736 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPN5Q6U736 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPN5Q6U736 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPN5Q6U736 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPN5Q6U736 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPN5Q6U736 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPN5Q6U736 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OPN5Q6U736 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OPN5Q6U736 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OPN5Q6U736 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
OPN5Q6U736 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPN5Q6U736 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPN5Q6U736 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPN5Q6U736 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPN5Q6U736 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPN5Q6U736 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OPN5Q6U736 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPN5Q6U736 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPN5Q6U736 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPN5Q6U736 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OPN5Q6U736 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPN5Q6U736 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms