Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNDC11Q6PKC3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNDC11Q6PKC3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNDC11Q6PKC3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXNDC11Q6PKC3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXNDC11Q6PKC3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNDC11Q6PKC3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNDC11Q6PKC3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNDC11Q6PKC3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNDC11Q6PKC3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNDC11Q6PKC3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC11Q6PKC3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC11Q6PKC3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC11Q6PKC3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC11Q6PKC3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC11Q6PKC3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC11Q6PKC3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC11Q6PKC3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC11Q6PKC3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC11Q6PKC3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC11Q6PKC3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC11Q6PKC3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNDC11Q6PKC3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNDC11Q6PKC3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TXNDC11Q6PKC3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TXNDC11Q6PKC3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNDC11Q6PKC3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXNDC11Q6PKC3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TXNDC11Q6PKC3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TXNDC11Q6PKC3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TXNDC11Q6PKC3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TXNDC11Q6PKC3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TXNDC11Q6PKC3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TXNDC11Q6PKC3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TXNDC11Q6PKC3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TXNDC11Q6PKC3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TXNDC11Q6PKC3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TXNDC11Q6PKC3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TXNDC11Q6PKC3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TXNDC11Q6PKC3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TXNDC11Q6PKC3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXNDC11Q6PKC3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms