Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPAL3Q6P499 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPAL3Q6P499 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPAL3Q6P499 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIPAL3Q6P499 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPAL3Q6P499 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPAL3Q6P499 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPAL3Q6P499 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPAL3Q6P499 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPAL3Q6P499 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPAL3Q6P499 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPAL3Q6P499 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPAL3Q6P499 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPAL3Q6P499 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPAL3Q6P499 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL3Q6P499 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL3Q6P499 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL3Q6P499 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL3Q6P499 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPAL3Q6P499 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPAL3Q6P499 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPAL3Q6P499 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPAL3Q6P499 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NIPAL3Q6P499 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPAL3Q6P499 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL3Q6P499 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL3Q6P499 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 518 ms