Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKK7

FAM219B, Protein FAM219B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM219BQ5XKK7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM219BQ5XKK7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM219BQ5XKK7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM219BQ5XKK7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM219BQ5XKK7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM219BQ5XKK7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM219BQ5XKK7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM219BQ5XKK7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM219BQ5XKK7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM219BQ5XKK7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM219BQ5XKK7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM219BQ5XKK7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM219BQ5XKK7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM219BQ5XKK7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM219BQ5XKK7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM219BQ5XKK7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM219BQ5XKK7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM219BQ5XKK7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM219BQ5XKK7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM219BQ5XKK7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM219BQ5XKK7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM219BQ5XKK7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM219BQ5XKK7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM219BQ5XKK7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM219BQ5XKK7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM219BQ5XKK7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM219BQ5XKK7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM219BQ5XKK7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM219BQ5XKK7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM219BQ5XKK7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM219BQ5XKK7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM219BQ5XKK7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM219BQ5XKK7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM219BQ5XKK7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM219BQ5XKK7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM219BQ5XKK7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM219BQ5XKK7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM219BQ5XKK7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM219BQ5XKK7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM219BQ5XKK7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM219BQ5XKK7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM219BQ5XKK7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM219BQ5XKK7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM219BQ5XKK7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM219BQ5XKK7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM219BQ5XKK7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM219BQ5XKK7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM219BQ5XKK7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM219BQ5XKK7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms