Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP6Q5VW22 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP6Q5VW22 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP6Q5VW22 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP6Q5VW22 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP6Q5VW22 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP6Q5VW22 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP6Q5VW22 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP6Q5VW22 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP6Q5VW22 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP6Q5VW22 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP6Q5VW22 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP6Q5VW22 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP6Q5VW22 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP6Q5VW22 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP6Q5VW22 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP6Q5VW22 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP6Q5VW22 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP6Q5VW22 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP6Q5VW22 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP6Q5VW22 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP6Q5VW22 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP6Q5VW22 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP6Q5VW22 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP6Q5VW22 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP6Q5VW22 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP6Q5VW22 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms