Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM164Q5U3C3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM164Q5U3C3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM164Q5U3C3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM164Q5U3C3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM164Q5U3C3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM164Q5U3C3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM164Q5U3C3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM164Q5U3C3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM164Q5U3C3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM164Q5U3C3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM164Q5U3C3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM164Q5U3C3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM164Q5U3C3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM164Q5U3C3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM164Q5U3C3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM164Q5U3C3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM164Q5U3C3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM164Q5U3C3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM164Q5U3C3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM164Q5U3C3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM164Q5U3C3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM164Q5U3C3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM164Q5U3C3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM164Q5U3C3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM164Q5U3C3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM164Q5U3C3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM164Q5U3C3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM164Q5U3C3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM164Q5U3C3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms