Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF5Q5TYX0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF5Q5TYX0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF5Q5TYX0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF5Q5TYX0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF5Q5TYX0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF5Q5TYX0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF5Q5TYX0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF5Q5TYX0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF5Q5TYX0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF5Q5TYX0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF5Q5TYX0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF5Q5TYX0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF5Q5TYX0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF5Q5TYX0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF5Q5TYX0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF5Q5TYX0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF5Q5TYX0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF5Q5TYX0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF5Q5TYX0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF5Q5TYX0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF5Q5TYX0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF5Q5TYX0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF5Q5TYX0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF5Q5TYX0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF5Q5TYX0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF5Q5TYX0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF5Q5TYX0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF5Q5TYX0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF5Q5TYX0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF5Q5TYX0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF5Q5TYX0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF5Q5TYX0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF5Q5TYX0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF5Q5TYX0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF5Q5TYX0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms