Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6L9

ERMARD, Endoplasmic reticulum membrane-associated RNA degradation protein, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERMARDQ5T6L9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERMARDQ5T6L9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERMARDQ5T6L9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERMARDQ5T6L9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERMARDQ5T6L9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERMARDQ5T6L9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERMARDQ5T6L9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERMARDQ5T6L9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERMARDQ5T6L9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERMARDQ5T6L9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERMARDQ5T6L9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERMARDQ5T6L9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERMARDQ5T6L9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERMARDQ5T6L9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERMARDQ5T6L9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERMARDQ5T6L9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERMARDQ5T6L9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERMARDQ5T6L9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERMARDQ5T6L9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERMARDQ5T6L9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERMARDQ5T6L9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERMARDQ5T6L9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERMARDQ5T6L9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERMARDQ5T6L9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERMARDQ5T6L9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERMARDQ5T6L9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERMARDQ5T6L9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERMARDQ5T6L9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERMARDQ5T6L9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERMARDQ5T6L9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERMARDQ5T6L9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERMARDQ5T6L9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERMARDQ5T6L9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERMARDQ5T6L9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ERMARDQ5T6L9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERMARDQ5T6L9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERMARDQ5T6L9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERMARDQ5T6L9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERMARDQ5T6L9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERMARDQ5T6L9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERMARDQ5T6L9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERMARDQ5T6L9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERMARDQ5T6L9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERMARDQ5T6L9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERMARDQ5T6L9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERMARDQ5T6L9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERMARDQ5T6L9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERMARDQ5T6L9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ERMARDQ5T6L9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERMARDQ5T6L9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERMARDQ5T6L9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERMARDQ5T6L9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERMARDQ5T6L9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERMARDQ5T6L9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERMARDQ5T6L9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERMARDQ5T6L9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERMARDQ5T6L9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERMARDQ5T6L9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERMARDQ5T6L9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERMARDQ5T6L9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERMARDQ5T6L9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERMARDQ5T6L9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ERMARDQ5T6L9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERMARDQ5T6L9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERMARDQ5T6L9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERMARDQ5T6L9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ERMARDQ5T6L9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ERMARDQ5T6L9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERMARDQ5T6L9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERMARDQ5T6L9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERMARDQ5T6L9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms