Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATAD3CQ5T2N8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAD3CQ5T2N8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAD3CQ5T2N8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3CQ5T2N8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3CQ5T2N8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAD3CQ5T2N8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAD3CQ5T2N8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD3CQ5T2N8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD3CQ5T2N8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3CQ5T2N8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATAD3CQ5T2N8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms