Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0L3

SPATA46, Spermatogenesis-associated protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA46Q5T0L3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA46Q5T0L3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA46Q5T0L3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA46Q5T0L3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA46Q5T0L3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA46Q5T0L3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA46Q5T0L3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA46Q5T0L3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA46Q5T0L3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA46Q5T0L3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA46Q5T0L3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA46Q5T0L3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA46Q5T0L3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA46Q5T0L3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA46Q5T0L3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA46Q5T0L3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA46Q5T0L3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA46Q5T0L3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms