Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL5A1-AS1Q5SY13 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL5A1-AS1Q5SY13 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL5A1-AS1Q5SY13 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL5A1-AS1Q5SY13 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL5A1-AS1Q5SY13 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms