Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF14Q5SWL7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF14Q5SWL7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF14Q5SWL7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF14Q5SWL7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF14Q5SWL7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF14Q5SWL7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF14Q5SWL7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF14Q5SWL7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF14Q5SWL7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF14Q5SWL7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF14Q5SWL7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF14Q5SWL7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF14Q5SWL7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF14Q5SWL7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF14Q5SWL7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF14Q5SWL7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF14Q5SWL7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF14Q5SWL7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF14Q5SWL7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF14Q5SWL7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF14Q5SWL7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF14Q5SWL7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF14Q5SWL7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF14Q5SWL7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF14Q5SWL7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF14Q5SWL7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF14Q5SWL7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF14Q5SWL7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF14Q5SWL7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF14Q5SWL7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF14Q5SWL7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF14Q5SWL7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF14Q5SWL7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF14Q5SWL7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF14Q5SWL7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF14Q5SWL7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF14Q5SWL7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF14Q5SWL7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF14Q5SWL7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF14Q5SWL7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF14Q5SWL7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF14Q5SWL7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms