Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NUP188Q5SRE5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NUP188Q5SRE5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP188Q5SRE5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP188Q5SRE5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP188Q5SRE5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
NUP188Q5SRE5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NUP188Q5SRE5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP188Q5SRE5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP188Q5SRE5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP188Q5SRE5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP188Q5SRE5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP188Q5SRE5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NUP188Q5SRE5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NUP188Q5SRE5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NUP188Q5SRE5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP188Q5SRE5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP188Q5SRE5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP188Q5SRE5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NUP188Q5SRE5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NUP188Q5SRE5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NUP188Q5SRE5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NUP188Q5SRE5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NUP188Q5SRE5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NUP188Q5SRE5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NUP188Q5SRE5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NUP188Q5SRE5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP188Q5SRE5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP188Q5SRE5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NUP188Q5SRE5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.34
NUP188Q5SRE5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NUP188Q5SRE5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
NUP188Q5SRE5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP188Q5SRE5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP188Q5SRE5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP188Q5SRE5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP188Q5SRE5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NUP188Q5SRE5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
NUP188Q5SRE5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
NUP188Q5SRE5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NUP188Q5SRE5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NUP188Q5SRE5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NUP188Q5SRE5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
NUP188Q5SRE5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NUP188Q5SRE5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NUP188Q5SRE5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NUP188Q5SRE5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NUP188Q5SRE5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
NUP188Q5SRE5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP188Q5SRE5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NUP188Q5SRE5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NUP188Q5SRE5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NUP188Q5SRE5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NUP188Q5SRE5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP188Q5SRE5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP188Q5SRE5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP188Q5SRE5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NUP188Q5SRE5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP188Q5SRE5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NUP188Q5SRE5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NUP188Q5SRE5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NUP188Q5SRE5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUP188Q5SRE5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUP188Q5SRE5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUP188Q5SRE5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NUP188Q5SRE5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUP188Q5SRE5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NUP188Q5SRE5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NUP188Q5SRE5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NUP188Q5SRE5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NUP188Q5SRE5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NUP188Q5SRE5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NUP188Q5SRE5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP188Q5SRE5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP188Q5SRE5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP188Q5SRE5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NUP188Q5SRE5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms