Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD3Q5JSP0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD3Q5JSP0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD3Q5JSP0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD3Q5JSP0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD3Q5JSP0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD3Q5JSP0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD3Q5JSP0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD3Q5JSP0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD3Q5JSP0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD3Q5JSP0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD3Q5JSP0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD3Q5JSP0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD3Q5JSP0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD3Q5JSP0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD3Q5JSP0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD3Q5JSP0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD3Q5JSP0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD3Q5JSP0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD3Q5JSP0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD3Q5JSP0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD3Q5JSP0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD3Q5JSP0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD3Q5JSP0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD3Q5JSP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD3Q5JSP0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD3Q5JSP0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD3Q5JSP0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD3Q5JSP0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD3Q5JSP0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD3Q5JSP0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD3Q5JSP0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms