Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMC4Q5J8M3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMC4Q5J8M3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMC4Q5J8M3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMC4Q5J8M3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMC4Q5J8M3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EMC4Q5J8M3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EMC4Q5J8M3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC4Q5J8M3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC4Q5J8M3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC4Q5J8M3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMC4Q5J8M3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMC4Q5J8M3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC4Q5J8M3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC4Q5J8M3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMC4Q5J8M3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMC4Q5J8M3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMC4Q5J8M3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMC4Q5J8M3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMC4Q5J8M3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMC4Q5J8M3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMC4Q5J8M3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EMC4Q5J8M3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EMC4Q5J8M3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMC4Q5J8M3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMC4Q5J8M3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMC4Q5J8M3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms