Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYI7

MTX3, Metaxin-3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTX3Q5HYI7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTX3Q5HYI7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTX3Q5HYI7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTX3Q5HYI7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTX3Q5HYI7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTX3Q5HYI7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTX3Q5HYI7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTX3Q5HYI7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTX3Q5HYI7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTX3Q5HYI7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTX3Q5HYI7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTX3Q5HYI7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTX3Q5HYI7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTX3Q5HYI7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTX3Q5HYI7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTX3Q5HYI7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTX3Q5HYI7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTX3Q5HYI7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MTX3Q5HYI7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MTX3Q5HYI7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTX3Q5HYI7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTX3Q5HYI7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTX3Q5HYI7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTX3Q5HYI7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTX3Q5HYI7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTX3Q5HYI7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTX3Q5HYI7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTX3Q5HYI7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTX3Q5HYI7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTX3Q5HYI7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTX3Q5HYI7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTX3Q5HYI7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTX3Q5HYI7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTX3Q5HYI7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTX3Q5HYI7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTX3Q5HYI7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTX3Q5HYI7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTX3Q5HYI7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTX3Q5HYI7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTX3Q5HYI7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTX3Q5HYI7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTX3Q5HYI7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTX3Q5HYI7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTX3Q5HYI7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTX3Q5HYI7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTX3Q5HYI7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTX3Q5HYI7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTX3Q5HYI7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTX3Q5HYI7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTX3Q5HYI7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTX3Q5HYI7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTX3Q5HYI7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms