Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HSP90AA4PQ58FG1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
HSP90AA4PQ58FG1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HSP90AA4PQ58FG1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HSP90AA4PQ58FG1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HSP90AA4PQ58FG1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HSP90AA4PQ58FG1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HSP90AA4PQ58FG1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HSP90AA4PQ58FG1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HSP90AA4PQ58FG1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HSP90AA4PQ58FG1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AA4PQ58FG1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AA4PQ58FG1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AA4PQ58FG1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AA4PQ58FG1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HSP90AA4PQ58FG1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HSP90AA4PQ58FG1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HSP90AA4PQ58FG1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HSP90AA4PQ58FG1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HSP90AA4PQ58FG1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HSP90AA4PQ58FG1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HSP90AA4PQ58FG1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AA4PQ58FG1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms