Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP13-2Q52LG2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP13-2Q52LG2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP13-2Q52LG2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP13-2Q52LG2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP13-2Q52LG2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms