Protein–RNA interactions for Protein: Q504T8

MIDN, Midnolin, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIDNQ504T8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIDNQ504T8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIDNQ504T8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIDNQ504T8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIDNQ504T8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIDNQ504T8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIDNQ504T8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MIDNQ504T8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIDNQ504T8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIDNQ504T8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIDNQ504T8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MIDNQ504T8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIDNQ504T8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIDNQ504T8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MIDNQ504T8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIDNQ504T8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIDNQ504T8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIDNQ504T8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIDNQ504T8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MIDNQ504T8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIDNQ504T8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MIDNQ504T8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIDNQ504T8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms