Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDNFQ49AH0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDNFQ49AH0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDNFQ49AH0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDNFQ49AH0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDNFQ49AH0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDNFQ49AH0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDNFQ49AH0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDNFQ49AH0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDNFQ49AH0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDNFQ49AH0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDNFQ49AH0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDNFQ49AH0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDNFQ49AH0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDNFQ49AH0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDNFQ49AH0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDNFQ49AH0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDNFQ49AH0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDNFQ49AH0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDNFQ49AH0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDNFQ49AH0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms