Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
FOXD4L6Q3SYB3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD4L6Q3SYB3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD4L6Q3SYB3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD4L6Q3SYB3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD4L6Q3SYB3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD4L6Q3SYB3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD4L6Q3SYB3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD4L6Q3SYB3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD4L6Q3SYB3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD4L6Q3SYB3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD4L6Q3SYB3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD4L6Q3SYB3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD4L6Q3SYB3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD4L6Q3SYB3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD4L6Q3SYB3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD4L6Q3SYB3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD4L6Q3SYB3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD4L6Q3SYB3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD4L6Q3SYB3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD4L6Q3SYB3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD4L6Q3SYB3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD4L6Q3SYB3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FOXD4L6Q3SYB3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD4L6Q3SYB3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD4L6Q3SYB3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD4L6Q3SYB3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD4L6Q3SYB3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD4L6Q3SYB3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD4L6Q3SYB3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXD4L6Q3SYB3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD4L6Q3SYB3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD4L6Q3SYB3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD4L6Q3SYB3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FOXD4L6Q3SYB3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FOXD4L6Q3SYB3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FOXD4L6Q3SYB3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FOXD4L6Q3SYB3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FOXD4L6Q3SYB3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FOXD4L6Q3SYB3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FOXD4L6Q3SYB3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FOXD4L6Q3SYB3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FOXD4L6Q3SYB3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FOXD4L6Q3SYB3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD4L6Q3SYB3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD4L6Q3SYB3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD4L6Q3SYB3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
FOXD4L6Q3SYB3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms