Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP6Q3SY56 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SP6Q3SY56 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP6Q3SY56 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP6Q3SY56 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP6Q3SY56 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP6Q3SY56 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP6Q3SY56 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP6Q3SY56 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP6Q3SY56 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SP6Q3SY56 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SP6Q3SY56 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP6Q3SY56 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP6Q3SY56 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP6Q3SY56 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP6Q3SY56 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP6Q3SY56 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP6Q3SY56 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms