Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSM12Q3MHD2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LSM12Q3MHD2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LSM12Q3MHD2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM12Q3MHD2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM12Q3MHD2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM12Q3MHD2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM12Q3MHD2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM12Q3MHD2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM12Q3MHD2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM12Q3MHD2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LSM12Q3MHD2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LSM12Q3MHD2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LSM12Q3MHD2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSM12Q3MHD2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSM12Q3MHD2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSM12Q3MHD2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LSM12Q3MHD2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSM12Q3MHD2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LSM12Q3MHD2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LSM12Q3MHD2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LSM12Q3MHD2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LSM12Q3MHD2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LSM12Q3MHD2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LSM12Q3MHD2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LSM12Q3MHD2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LSM12Q3MHD2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM12Q3MHD2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM12Q3MHD2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LSM12Q3MHD2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM12Q3MHD2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM12Q3MHD2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM12Q3MHD2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM12Q3MHD2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LSM12Q3MHD2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms