Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1BQ3KR37 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1BQ3KR37 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1BQ3KR37 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1BQ3KR37 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1BQ3KR37 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1BQ3KR37 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1BQ3KR37 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1BQ3KR37 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1BQ3KR37 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1BQ3KR37 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1BQ3KR37 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1BQ3KR37 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1BQ3KR37 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1BQ3KR37 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1BQ3KR37 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1BQ3KR37 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1BQ3KR37 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1BQ3KR37 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1BQ3KR37 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRAMD1BQ3KR37 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRAMD1BQ3KR37 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1BQ3KR37 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRAMD1BQ3KR37 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRAMD1BQ3KR37 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRAMD1BQ3KR37 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRAMD1BQ3KR37 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRAMD1BQ3KR37 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRAMD1BQ3KR37 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRAMD1BQ3KR37 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRAMD1BQ3KR37 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRAMD1BQ3KR37 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRAMD1BQ3KR37 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRAMD1BQ3KR37 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRAMD1BQ3KR37 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRAMD1BQ3KR37 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRAMD1BQ3KR37 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRAMD1BQ3KR37 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRAMD1BQ3KR37 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD1BQ3KR37 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD1BQ3KR37 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD1BQ3KR37 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD1BQ3KR37 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD1BQ3KR37 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRAMD1BQ3KR37 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRAMD1BQ3KR37 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRAMD1BQ3KR37 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD1BQ3KR37 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms