Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms