Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
COL24A1Q17RW2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
COL24A1Q17RW2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
COL24A1Q17RW2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
COL24A1Q17RW2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
COL24A1Q17RW2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
COL24A1Q17RW2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
COL24A1Q17RW2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
COL24A1Q17RW2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
COL24A1Q17RW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
COL24A1Q17RW2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
COL24A1Q17RW2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
COL24A1Q17RW2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
COL24A1Q17RW2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
COL24A1Q17RW2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
COL24A1Q17RW2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
COL24A1Q17RW2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
COL24A1Q17RW2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
COL24A1Q17RW2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL24A1Q17RW2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL24A1Q17RW2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
COL24A1Q17RW2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
COL24A1Q17RW2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL24A1Q17RW2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL24A1Q17RW2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL24A1Q17RW2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL24A1Q17RW2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
COL24A1Q17RW2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
COL24A1Q17RW2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
COL24A1Q17RW2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
COL24A1Q17RW2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
COL24A1Q17RW2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
COL24A1Q17RW2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
COL24A1Q17RW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
COL24A1Q17RW2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
COL24A1Q17RW2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
COL24A1Q17RW2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
COL24A1Q17RW2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
COL24A1Q17RW2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
COL24A1Q17RW2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
COL24A1Q17RW2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
COL24A1Q17RW2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
COL24A1Q17RW2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
COL24A1Q17RW2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
COL24A1Q17RW2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
COL24A1Q17RW2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
COL24A1Q17RW2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL24A1Q17RW2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
COL24A1Q17RW2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
COL24A1Q17RW2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
COL24A1Q17RW2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
COL24A1Q17RW2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
COL24A1Q17RW2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
COL24A1Q17RW2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
COL24A1Q17RW2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
COL24A1Q17RW2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
COL24A1Q17RW2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
COL24A1Q17RW2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
COL24A1Q17RW2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
COL24A1Q17RW2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
COL24A1Q17RW2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
COL24A1Q17RW2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
COL24A1Q17RW2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
COL24A1Q17RW2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
COL24A1Q17RW2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
COL24A1Q17RW2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
COL24A1Q17RW2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
COL24A1Q17RW2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
COL24A1Q17RW2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
COL24A1Q17RW2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
COL24A1Q17RW2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
COL24A1Q17RW2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
COL24A1Q17RW2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
COL24A1Q17RW2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms