Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPROQ16827 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPROQ16827 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPROQ16827 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPROQ16827 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPROQ16827 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPROQ16827 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPROQ16827 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPROQ16827 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPROQ16827 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPROQ16827 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPROQ16827 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPROQ16827 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPROQ16827 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPROQ16827 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPROQ16827 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPROQ16827 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPROQ16827 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPROQ16827 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPROQ16827 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPROQ16827 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPROQ16827 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPROQ16827 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPROQ16827 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPROQ16827 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPROQ16827 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPROQ16827 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPROQ16827 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPROQ16827 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPROQ16827 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPROQ16827 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPROQ16827 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPROQ16827 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPROQ16827 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPROQ16827 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPROQ16827 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPROQ16827 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPROQ16827 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPROQ16827 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPROQ16827 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
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