Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CA9Q16790 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CA9Q16790 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CA9Q16790 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CA9Q16790 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CA9Q16790 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CA9Q16790 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CA9Q16790 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CA9Q16790 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CA9Q16790 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CA9Q16790 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CA9Q16790 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CA9Q16790 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CA9Q16790 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CA9Q16790 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CA9Q16790 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CA9Q16790 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CA9Q16790 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CA9Q16790 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CA9Q16790 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CA9Q16790 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CA9Q16790 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CA9Q16790 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CA9Q16790 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CA9Q16790 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CA9Q16790 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CA9Q16790 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CA9Q16790 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CA9Q16790 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CA9Q16790 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CA9Q16790 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CA9Q16790 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CA9Q16790 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CA9Q16790 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CA9Q16790 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CA9Q16790 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CA9Q16790 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CA9Q16790 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CA9Q16790 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CA9Q16790 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CA9Q16790 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CA9Q16790 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CA9Q16790 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CA9Q16790 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CA9Q16790 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CA9Q16790 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CA9Q16790 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CA9Q16790 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CA9Q16790 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CA9Q16790 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CA9Q16790 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CA9Q16790 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CA9Q16790 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CA9Q16790 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CA9Q16790 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CA9Q16790 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CA9Q16790 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CA9Q16790 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CA9Q16790 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CA9Q16790 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CA9Q16790 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CA9Q16790 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CA9Q16790 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CA9Q16790 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CA9Q16790 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CA9Q16790 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CA9Q16790 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CA9Q16790 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CA9Q16790 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CA9Q16790 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CA9Q16790 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CA9Q16790 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CA9Q16790 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CA9Q16790 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CA9Q16790 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CA9Q16790 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CA9Q16790 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CA9Q16790 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CA9Q16790 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CA9Q16790 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CA9Q16790 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CA9Q16790 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CA9Q16790 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CA9Q16790 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CA9Q16790 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CA9Q16790 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CA9Q16790 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CA9Q16790 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CA9Q16790 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CA9Q16790 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CA9Q16790 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CA9Q16790 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CA9Q16790 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CA9Q16790 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CA9Q16790 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CA9Q16790 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CA9Q16790 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CA9Q16790 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CA9Q16790 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CA9Q16790 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms