Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC18A3Q16572 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC18A3Q16572 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC18A3Q16572 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC18A3Q16572 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC18A3Q16572 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC18A3Q16572 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC18A3Q16572 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC18A3Q16572 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC18A3Q16572 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC18A3Q16572 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC18A3Q16572 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC18A3Q16572 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC18A3Q16572 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC18A3Q16572 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC18A3Q16572 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC18A3Q16572 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC18A3Q16572 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC18A3Q16572 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC18A3Q16572 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC18A3Q16572 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC18A3Q16572 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC18A3Q16572 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC18A3Q16572 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC18A3Q16572 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC18A3Q16572 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC18A3Q16572 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC18A3Q16572 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC18A3Q16572 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC18A3Q16572 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC18A3Q16572 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC18A3Q16572 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
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