Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LY6EQ16553 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LY6EQ16553 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LY6EQ16553 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LY6EQ16553 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LY6EQ16553 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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