Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NWD1Q149M9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NWD1Q149M9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NWD1Q149M9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NWD1Q149M9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NWD1Q149M9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NWD1Q149M9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NWD1Q149M9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NWD1Q149M9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NWD1Q149M9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NWD1Q149M9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NWD1Q149M9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NWD1Q149M9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
NWD1Q149M9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NWD1Q149M9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NWD1Q149M9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NWD1Q149M9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NWD1Q149M9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NWD1Q149M9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
NWD1Q149M9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NWD1Q149M9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NWD1Q149M9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
NWD1Q149M9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NWD1Q149M9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
NWD1Q149M9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NWD1Q149M9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NWD1Q149M9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NWD1Q149M9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
NWD1Q149M9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
NWD1Q149M9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NWD1Q149M9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NWD1Q149M9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
NWD1Q149M9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
NWD1Q149M9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NWD1Q149M9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
NWD1Q149M9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NWD1Q149M9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NWD1Q149M9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NWD1Q149M9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NWD1Q149M9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NWD1Q149M9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NWD1Q149M9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NWD1Q149M9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NWD1Q149M9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
NWD1Q149M9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NWD1Q149M9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NWD1Q149M9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
NWD1Q149M9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NWD1Q149M9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NWD1Q149M9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
NWD1Q149M9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NWD1Q149M9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NWD1Q149M9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NWD1Q149M9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NWD1Q149M9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NWD1Q149M9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NWD1Q149M9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NWD1Q149M9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NWD1Q149M9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NWD1Q149M9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NWD1Q149M9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NWD1Q149M9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NWD1Q149M9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NWD1Q149M9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NWD1Q149M9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NWD1Q149M9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NWD1Q149M9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NWD1Q149M9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NWD1Q149M9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NWD1Q149M9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NWD1Q149M9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NWD1Q149M9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NWD1Q149M9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NWD1Q149M9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NWD1Q149M9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NWD1Q149M9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
NWD1Q149M9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NWD1Q149M9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
NWD1Q149M9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NWD1Q149M9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NWD1Q149M9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
NWD1Q149M9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
NWD1Q149M9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
NWD1Q149M9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
NWD1Q149M9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NWD1Q149M9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NWD1Q149M9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
NWD1Q149M9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
NWD1Q149M9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
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