Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NR1I3Q14994 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NR1I3Q14994 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NR1I3Q14994 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NR1I3Q14994 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NR1I3Q14994 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NR1I3Q14994 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NR1I3Q14994 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NR1I3Q14994 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NR1I3Q14994 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NR1I3Q14994 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NR1I3Q14994 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NR1I3Q14994 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NR1I3Q14994 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NR1I3Q14994 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NR1I3Q14994 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NR1I3Q14994 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NR1I3Q14994 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NR1I3Q14994 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NR1I3Q14994 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NR1I3Q14994 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR1I3Q14994 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR1I3Q14994 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NR1I3Q14994 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR1I3Q14994 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NR1I3Q14994 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NR1I3Q14994 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NR1I3Q14994 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NR1I3Q14994 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NR1I3Q14994 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NR1I3Q14994 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NR1I3Q14994 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NR1I3Q14994 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NR1I3Q14994 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NR1I3Q14994 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NR1I3Q14994 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NR1I3Q14994 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR1I3Q14994 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR1I3Q14994 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NR1I3Q14994 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NR1I3Q14994 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NR1I3Q14994 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NR1I3Q14994 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NR1I3Q14994 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NR1I3Q14994 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NR1I3Q14994 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NR1I3Q14994 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NR1I3Q14994 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NR1I3Q14994 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NR1I3Q14994 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NR1I3Q14994 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NR1I3Q14994 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NR1I3Q14994 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NR1I3Q14994 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR1I3Q14994 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR1I3Q14994 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NR1I3Q14994 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR1I3Q14994 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NR1I3Q14994 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NR1I3Q14994 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NR1I3Q14994 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NR1I3Q14994 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
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