Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NFIXQ14938 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NFIXQ14938 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NFIXQ14938 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NFIXQ14938 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NFIXQ14938 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NFIXQ14938 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NFIXQ14938 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NFIXQ14938 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NFIXQ14938 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NFIXQ14938 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NFIXQ14938 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NFIXQ14938 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NFIXQ14938 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NFIXQ14938 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NFIXQ14938 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NFIXQ14938 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NFIXQ14938 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NFIXQ14938 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NFIXQ14938 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NFIXQ14938 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NFIXQ14938 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NFIXQ14938 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NFIXQ14938 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NFIXQ14938 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NFIXQ14938 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NFIXQ14938 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NFIXQ14938 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NFIXQ14938 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NFIXQ14938 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NFIXQ14938 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NFIXQ14938 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NFIXQ14938 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NFIXQ14938 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NFIXQ14938 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NFIXQ14938 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NFIXQ14938 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NFIXQ14938 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NFIXQ14938 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NFIXQ14938 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NFIXQ14938 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NFIXQ14938 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NFIXQ14938 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NFIXQ14938 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NFIXQ14938 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NFIXQ14938 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NFIXQ14938 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NFIXQ14938 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NFIXQ14938 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NFIXQ14938 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NFIXQ14938 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NFIXQ14938 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NFIXQ14938 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NFIXQ14938 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NFIXQ14938 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NFIXQ14938 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NFIXQ14938 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NFIXQ14938 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NFIXQ14938 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NFIXQ14938 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NFIXQ14938 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NFIXQ14938 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NFIXQ14938 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NFIXQ14938 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NFIXQ14938 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NFIXQ14938 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NFIXQ14938 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NFIXQ14938 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NFIXQ14938 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NFIXQ14938 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NFIXQ14938 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NFIXQ14938 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NFIXQ14938 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NFIXQ14938 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NFIXQ14938 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NFIXQ14938 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NFIXQ14938 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NFIXQ14938 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NFIXQ14938 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NFIXQ14938 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NFIXQ14938 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NFIXQ14938 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NFIXQ14938 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NFIXQ14938 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
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