Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMCO1Q147U7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMCO1Q147U7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMCO1Q147U7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMCO1Q147U7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMCO1Q147U7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMCO1Q147U7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMCO1Q147U7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMCO1Q147U7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMCO1Q147U7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMCO1Q147U7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMCO1Q147U7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMCO1Q147U7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMCO1Q147U7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMCO1Q147U7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMCO1Q147U7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMCO1Q147U7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMCO1Q147U7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMCO1Q147U7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMCO1Q147U7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMCO1Q147U7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMCO1Q147U7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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