Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCN5AQ14524 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN5AQ14524 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN5AQ14524 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN5AQ14524 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN5AQ14524 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN5AQ14524 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN5AQ14524 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN5AQ14524 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCN5AQ14524 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCN5AQ14524 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCN5AQ14524 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCN5AQ14524 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCN5AQ14524 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN5AQ14524 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN5AQ14524 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN5AQ14524 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCN5AQ14524 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCN5AQ14524 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN5AQ14524 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCN5AQ14524 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCN5AQ14524 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SCN5AQ14524 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN5AQ14524 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN5AQ14524 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN5AQ14524 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCN5AQ14524 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCN5AQ14524 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCN5AQ14524 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN5AQ14524 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN5AQ14524 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN5AQ14524 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN5AQ14524 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCN5AQ14524 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCN5AQ14524 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN5AQ14524 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN5AQ14524 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN5AQ14524 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN5AQ14524 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN5AQ14524 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN5AQ14524 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCN5AQ14524 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN5AQ14524 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN5AQ14524 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN5AQ14524 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN5AQ14524 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN5AQ14524 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN5AQ14524 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN5AQ14524 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN5AQ14524 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN5AQ14524 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN5AQ14524 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN5AQ14524 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN5AQ14524 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCN5AQ14524 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN5AQ14524 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN5AQ14524 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN5AQ14524 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN5AQ14524 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN5AQ14524 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN5AQ14524 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN5AQ14524 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
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