Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNX3Q13761 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNX3Q13761 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUNX3Q13761 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNX3Q13761 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNX3Q13761 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNX3Q13761 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNX3Q13761 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNX3Q13761 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNX3Q13761 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNX3Q13761 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNX3Q13761 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNX3Q13761 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUNX3Q13761 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RUNX3Q13761 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNX3Q13761 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNX3Q13761 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNX3Q13761 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNX3Q13761 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUNX3Q13761 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUNX3Q13761 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUNX3Q13761 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUNX3Q13761 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNX3Q13761 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNX3Q13761 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNX3Q13761 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUNX3Q13761 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUNX3Q13761 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNX3Q13761 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNX3Q13761 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNX3Q13761 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNX3Q13761 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUNX3Q13761 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUNX3Q13761 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUNX3Q13761 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNX3Q13761 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNX3Q13761 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNX3Q13761 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNX3Q13761 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUNX3Q13761 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
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