Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FHL3Q13643 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FHL3Q13643 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FHL3Q13643 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FHL3Q13643 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FHL3Q13643 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FHL3Q13643 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FHL3Q13643 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FHL3Q13643 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FHL3Q13643 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FHL3Q13643 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FHL3Q13643 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FHL3Q13643 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FHL3Q13643 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FHL3Q13643 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FHL3Q13643 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FHL3Q13643 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHL3Q13643 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms