Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPM6BQ13491 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPM6BQ13491 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPM6BQ13491 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPM6BQ13491 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPM6BQ13491 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPM6BQ13491 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPM6BQ13491 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPM6BQ13491 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPM6BQ13491 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPM6BQ13491 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GPM6BQ13491 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPM6BQ13491 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPM6BQ13491 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPM6BQ13491 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPM6BQ13491 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPM6BQ13491 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPM6BQ13491 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPM6BQ13491 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPM6BQ13491 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPM6BQ13491 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPM6BQ13491 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPM6BQ13491 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPM6BQ13491 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPM6BQ13491 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPM6BQ13491 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPM6BQ13491 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPM6BQ13491 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPM6BQ13491 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPM6BQ13491 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPM6BQ13491 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GPM6BQ13491 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPM6BQ13491 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPM6BQ13491 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPM6BQ13491 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPM6BQ13491 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPM6BQ13491 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPM6BQ13491 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPM6BQ13491 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPM6BQ13491 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPM6BQ13491 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPM6BQ13491 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPM6BQ13491 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPM6BQ13491 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
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