Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE2V1Q13404 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE2V1Q13404 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2V1Q13404 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2V1Q13404 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2V1Q13404 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2V1Q13404 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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