Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRSQ13332 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRSQ13332 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRSQ13332 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRSQ13332 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRSQ13332 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRSQ13332 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRSQ13332 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRSQ13332 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRSQ13332 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRSQ13332 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRSQ13332 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRSQ13332 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRSQ13332 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRSQ13332 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRSQ13332 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRSQ13332 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRSQ13332 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRSQ13332 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRSQ13332 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRSQ13332 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRSQ13332 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRSQ13332 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRSQ13332 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRSQ13332 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRSQ13332 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRSQ13332 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRSQ13332 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRSQ13332 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRSQ13332 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRSQ13332 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRSQ13332 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRSQ13332 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRSQ13332 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRSQ13332 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRSQ13332 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRSQ13332 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRSQ13332 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRSQ13332 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRSQ13332 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRSQ13332 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRSQ13332 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRSQ13332 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRSQ13332 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRSQ13332 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRSQ13332 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRSQ13332 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRSQ13332 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRSQ13332 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRSQ13332 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRSQ13332 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRSQ13332 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRSQ13332 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRSQ13332 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRSQ13332 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRSQ13332 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRSQ13332 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRSQ13332 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
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