Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTGDRQ13258 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTGDRQ13258 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PTGDRQ13258 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTGDRQ13258 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGDRQ13258 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGDRQ13258 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGDRQ13258 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTGDRQ13258 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTGDRQ13258 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTGDRQ13258 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTGDRQ13258 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGDRQ13258 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGDRQ13258 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGDRQ13258 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTGDRQ13258 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTGDRQ13258 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTGDRQ13258 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTGDRQ13258 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTGDRQ13258 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PTGDRQ13258 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTGDRQ13258 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTGDRQ13258 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTGDRQ13258 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTGDRQ13258 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTGDRQ13258 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTGDRQ13258 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTGDRQ13258 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTGDRQ13258 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTGDRQ13258 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTGDRQ13258 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTGDRQ13258 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTGDRQ13258 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PTGDRQ13258 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTGDRQ13258 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTGDRQ13258 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTGDRQ13258 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTGDRQ13258 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTGDRQ13258 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTGDRQ13258 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTGDRQ13258 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTGDRQ13258 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTGDRQ13258 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTGDRQ13258 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTGDRQ13258 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTGDRQ13258 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PTGDRQ13258 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTGDRQ13258 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTGDRQ13258 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PTGDRQ13258 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGDRQ13258 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGDRQ13258 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGDRQ13258 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGDRQ13258 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGDRQ13258 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGDRQ13258 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGDRQ13258 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGDRQ13258 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
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