Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALCOCO2Q13137 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALCOCO2Q13137 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALCOCO2Q13137 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALCOCO2Q13137 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALCOCO2Q13137 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALCOCO2Q13137 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALCOCO2Q13137 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALCOCO2Q13137 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALCOCO2Q13137 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALCOCO2Q13137 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALCOCO2Q13137 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALCOCO2Q13137 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALCOCO2Q13137 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCOCO2Q13137 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCOCO2Q13137 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALCOCO2Q13137 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALCOCO2Q13137 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALCOCO2Q13137 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALCOCO2Q13137 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALCOCO2Q13137 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALCOCO2Q13137 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALCOCO2Q13137 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CALCOCO2Q13137 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALCOCO2Q13137 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALCOCO2Q13137 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALCOCO2Q13137 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALCOCO2Q13137 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALCOCO2Q13137 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALCOCO2Q13137 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALCOCO2Q13137 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALCOCO2Q13137 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALCOCO2Q13137 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CALCOCO2Q13137 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALCOCO2Q13137 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CALCOCO2Q13137 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALCOCO2Q13137 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALCOCO2Q13137 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALCOCO2Q13137 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALCOCO2Q13137 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALCOCO2Q13137 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALCOCO2Q13137 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALCOCO2Q13137 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALCOCO2Q13137 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CALCOCO2Q13137 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CALCOCO2Q13137 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALCOCO2Q13137 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CALCOCO2Q13137 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CALCOCO2Q13137 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALCOCO2Q13137 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALCOCO2Q13137 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALCOCO2Q13137 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALCOCO2Q13137 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
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