Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN13Q12923 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN13Q12923 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN13Q12923 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN13Q12923 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN13Q12923 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN13Q12923 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN13Q12923 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN13Q12923 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN13Q12923 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN13Q12923 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN13Q12923 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN13Q12923 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN13Q12923 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN13Q12923 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN13Q12923 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN13Q12923 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN13Q12923 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN13Q12923 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN13Q12923 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN13Q12923 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN13Q12923 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN13Q12923 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN13Q12923 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN13Q12923 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN13Q12923 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN13Q12923 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN13Q12923 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN13Q12923 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN13Q12923 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN13Q12923 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN13Q12923 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN13Q12923 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN13Q12923 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN13Q12923 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN13Q12923 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN13Q12923 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN13Q12923 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN13Q12923 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN13Q12923 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN13Q12923 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN13Q12923 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN13Q12923 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN13Q12923 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
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