Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TP53BP1Q12888 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TP53BP1Q12888 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TP53BP1Q12888 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TP53BP1Q12888 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TP53BP1Q12888 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TP53BP1Q12888 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TP53BP1Q12888 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TP53BP1Q12888 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TP53BP1Q12888 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TP53BP1Q12888 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TP53BP1Q12888 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TP53BP1Q12888 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TP53BP1Q12888 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TP53BP1Q12888 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TP53BP1Q12888 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TP53BP1Q12888 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TP53BP1Q12888 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TP53BP1Q12888 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TP53BP1Q12888 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TP53BP1Q12888 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TP53BP1Q12888 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TP53BP1Q12888 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TP53BP1Q12888 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TP53BP1Q12888 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TP53BP1Q12888 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TP53BP1Q12888 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TP53BP1Q12888 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TP53BP1Q12888 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP53BP1Q12888 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP53BP1Q12888 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP53BP1Q12888 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TP53BP1Q12888 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TP53BP1Q12888 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TP53BP1Q12888 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms